北京301医院拥有1个国家重点实验室、2个教育部重点实验室、9个北京市重点实验室，12个全军医学专业重点实验室，国家临床医学研究中心1个，国际联合研究中心1个，形成了以综合诊疗为特色的13项专业优势。
令狐恩强率先定名完善消化内镜隧道技术，模糊了消化内外科的界限，替代了一批传统外科手术；率先提出基于保持人体解剖结构不变条件下，达到祛除疾病目的的超级微创手术新概念，替代长期存在以切除器官为代价的手术模式，为未来手术方法学与器械研发指明了方向。
北京301医院消化科令狐恩强擅长消化内镜的诊断与治 疗:除常规的胃肠镜诊断与治 疗外,在以下方面具有丰富的内镜诊治经验:(1)食管良性狭窄、食管癌:(2)食管胃底静脉曲张的硬化剂、套扎器、组织胶注射治 疗;(3)内镜下胰胆管疾病的诊治:胆管结石、胆管癌、胰腺癌、胰腺炎、内镜下胰胆管腔内超声、经皮经肝穿刺与内镜下对接治 疗恶性胆管狭窄、十二指肠乳头肿瘤内镜下切除术等胰胆管疾病的内镜下诊治:(4)贲门折叠术治 疗胃食管反流病。
目前我国癌症发病率前五名里，与消化道相关的肿瘤占四个，分别是胃癌、结直肠癌、肝癌和食管癌。我国消化道肿瘤不仅发病率高，且病死率亦高居不下，所以开展消化道肿瘤的筛查与治 疗刻不容缓。